石碶站位于雅戈爾大道與鄞縣大道交叉口北側,為2號線與規劃遠期5號線換乘車站。車站周邊規劃以居住和商業用地為主。路口東北象限有中國農業銀行,新南塘河位于車站北側,其上為石碶橋,橋面寬44m。路口西南象限為寧波奧星汽車服務有限公司車間,路口東南側為新南塘河支流和雅渡新村。車站為地下三層島式站臺車站。地下一層為站廳層,地下二層為設備層,地下三層為站臺層。車站設自動售檢票機8臺,閘機21臺,客服中心1個。運營初期開放A、C兩個出入口。其中A出入口位于位于雅戈爾大道旁的洛茲廣場附近,靠近石碶橋;C出入口位于雅戈爾大道、鄞縣大道交叉路口東南角。