三官堂站為2號線與5號線換乘車站，車站主體沿寧鎮公路設置，橫跨風華路，位于浙江紡織職業技術學院門口西側，車站附屬用房位于風華路南側。車站為高架四層側式站臺車站。首層為地面市政道路，二層為過街天橋層，三層為站廳層，四層為站臺層。車站設自動售檢票機6臺，閘機12臺，客服中心1個。運營初期開放A、B兩個出入口。A出入口位于風華路北側，規劃明海南路東側，距寧波紡織學院西南方300米;B出入口位于風華路南側，規劃明海南路東側。