2013年4月,南京地鐵S1號線二期土建工程(剩余段)已經主管部門批準建設,即將開工建設。2014年9月26日上午,位于南京市高淳區的地鐵S1號線高淳特大橋第一片450噸預制梁順利架設成功,標志著該工程進入了新的施工生產階段。2014年11月11日下午4時,南京地鐵S1號線二期TA02標項目部率先成功架設全線第一片U形預制梁。2014年11月24日,地鐵S1號線二期項目路基部分已完成土方填筑51850方,剩余31000方。2015年8月24日,由中鐵四局建筑公司項目部承建的地鐵S1號線二期工程的兩個最大單體(組合廠房和綜合樓)基礎施工全部完成,標志著該工程正式進入主體施工關鍵階段。